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2. 虚拟机ubuntu14.04编译MPI版本NAMD_飞天小建建的博客3.根据官方的教程,选择mpi版本的编译教程手册,http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.12b1/notes.html#compiling,从Compiling NAMD处开始跟着做,注意选择MPI版本的编译教程。 4.编译好之后,运行程序便是:NAMD_2.12b1_Source/Linux...
3. NAMD在window下的安装 -NAMD在window下的安装,NAMD—ScalaleMolecularDyamic是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学软件。但是,NAMD不是通过etu直接安装的,它是使用CMD命令调用。下面是NAMD的安装过程。
4. [转载]NAMD硬件利用率分析(Xeon-Scalable 8180和8 GTX/opt/namd/namd-multicore +p56 +setcpuaffinity +idlepoll +devices 0,1,2,3,4,5,6,7 stmv.namd +devices后面列出了运行用到的GPU。上面的命令行就开启了8块GPU。本次会依次测试1块到8块GPU的性能表现。
5. NAMD - Scalable Molecular DynamicsNAMD is a parallel molecular dynamics code for large biomolecular systems. NAMD is free with source code.
6. namd入门教程(一)分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulation)是指利用计算机软件,根据牛顿力学的基本原理,模拟大分子的相互作用和运动变化的研究方法。namd是比较好用的一款软件,本教程是入门的经典之作。
7. 如何优雅地完成蛋白质的动力学模拟-NAMD -请自行前往NAMD网站,注册下载X86_64-multicore-CUDA 版本的免安装直接使用的包。并点击下载网址复制,备用,注意不是下载,是复制备用。 该软件对所有人免费 所需版本 我们将使用colab 或者 百度人工智能AI studio提供的免费GPU来进行NAMD的...
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