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2. NAMD - Scalable Molecular DynamicsNAMD is a parallel molecular dynamics code for large biomolecular systems. NAMD is free with source code.
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5. [转载]NAMD硬件利用率分析(Xeon-Scalable 8180和8 GTX/opt/namd/namd-multicore +p56 +setcpuaffinity +idlepoll +devices 0,1,2,3,4,5,6,7 stmv.namd +devices后面列出了运行用到的GPU。上面的命令行就开启了8块GPU。本次会依次测试1块到8块GPU的性能表现。
6. namd入门教程(一)namd入门教程(一)评分: 分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulation)是指利用计算机软件,根据牛顿力学的基本原理,模拟大分子的相互作用和运动变化的研究方法。namd是比较好用的一款软件,本教程是入门的经典之作。
7. NAMD在window下的安装 -NAMD在window下的安装,NAMD—ScalaleMolecularDyamic是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学软件。但是,NAMD不是通过etu直接安装的,它是使用CMD命令调用。下面是NAMD的安装过程。
NAMD-018