PPP项目涉及应缴纳的税金主要有增值税、增值税附加和企业所得税，缴税环节主要集中在项目建设期和运营期。
（一）概述
增值税是以商品（含应税劳务与应税行为）在流转过程中产生的增值额作为计税依据而征收的一种流转税。
增值税是价外税，税收不影响企业的成本和效益。在财务测算中计入利润表中的收入是不含增值税销项税的收入，成本中不含增值税进项税。但增值税是企业经营活动中一种实际发生的现金流动，因此，它会出现在“现金流量表”中。
（二）税率与计算
PPP项目增值税税率一般为11%。
应纳税额=当期销项税—当期进项税额
上式中，当期销项税额是指纳税人销售货物或者提供应税劳务、应税行为向购买方收取的增值税额。
销项税额=销售额×税率
当期进项税额，是指纳税人购进货物、服务、无形资产或者不动产，支付的增值税额。
（三）增值税优惠政策
在资源综合利用和环境保护领域，财政部、国家税务总局曾出台相关增值税优惠政策，包括：（1）销售自产的再生水免增值税；（2）污水处理劳务免征增值税；（3）垃圾处理、污泥处理处置劳务免征增值税。2015年6月，财政部和国税总局联合发文，将上述免征增值税政策改为享受即征即退政策，其中，垃圾、污泥、污水处理劳务享受退税优惠70%，再生水享受退税优惠50%。
对公路经营企业收取的高速公路车辆通行费收入统一减按3%的税率征收增值税。
二、增值税附加
凡缴纳流转税（增值税和消费税）的单位和个人还需要缴纳城市维护建设税、教育费附加和地方教育费附加，二者均以纳税人实际缴纳的增值税税额为计税依据，按照一定的税率进行缴纳。
城建税税率根据纳税人所在地不同分为3档：纳税人所在地在市区的，税率为7%；所在地在县城、镇的，税率为5%；其他地区税率为1%。
教育费附加税率为3%，地方教育费附加的税率为2%。
一般项目公司增值税附加适用的税率为12%。
三、企业所得税
（一）计税方法
企业所得税是企业每一纳税年度（自公历1月1日起至12月31日止）的收入总额减除成本、费用及损失后的余额，为应纳税所得额。
PPP项目的应纳税所得额计算公式：
应纳税所得额=收入总额—（经营成本+折旧摊销+应偿还的借款利息）
按照税法和会计核算的规定，上式中的收入为不含增值税的收入。
企业所得税税率为25%。
（二）所得税税收优惠
1.三免三减半
财政部、国税总局出台《公共基础设施项目企业所得税优惠目录》（财税[2008]46号、国税发[2009]80号）规定，投资企业从事规定范围、条件标准的港口码头、机场、铁路、公路、城市公共交通、电力i、水利等公共基础设施项目，公共污水处理、公共垃圾处理、沼气综合开发利用、节能减排技术改造、海水淡化等环境保护、节能节水项目的所得，自该项目取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第一年至第三年免征企业所得税，第四年至第六年减半征收企业所得税。
2.投资抵免企业所得税
按照财政部、国税总局、国家发改委、安监总局公布的《环境保护专用设备企业所得税优惠目录》、《节能节水专用设备企业所得税优惠目录》和《安全生产专用设备企业所得税优惠目录》的规定，企业购置购置并实际使用环境保护、节能节水、安全生产等专用设备的，该专用设备的投资额的10%可以从企业当年的应纳税额中抵免；当年不足抵免的，可以在以后5个纳税年度中结转抵免。
3.其他优惠
（1）国家对重点扶持和鼓励发展的产业项目，给予企业所得税优惠。
（2）符合条件的居民企业之间的股息、红利等权益性投资收益（社会资本方的股权分红）——免征所得税。境内居民企业分配股利给自然人股东，需代扣代缴20%个人所得税。
（3）从事国家重点扶持的公共基础设施项目投资经营所得；从事符合条件的环境保护、节能节水项目的所得——可以免征、减征企业所得税。
（4）企业的固定资产由于技术进步等原因，的确需要加速折旧的，可以缩短折旧年限或者采取加速折旧的方法。
（5）企业综合利用资源，生产符合国家产业政策规定的产品所取得的收入，可以在计算应纳所得额时减计收入。
4.几点说明
所得税纳税年度以企业开始获利之年起计。开始获利年度，是指企业开始生产经营后，第一个获得利润的纳税年度。
如果企业经营期初发生年度亏损，可以用下一纳税年度的所得来弥补；下一纳税年度的所得不足弥补的，可以逐年结转弥补，但最长不得超过5年。在这种情况下，开始获利年度为弥补亏损后有利润的纳税年度。当开始获利年度超过了最长弥补亏损期（5年）时，则亏损弥补期后的第一年应视为开始获利年度。
（3）一般情况下，项目公司当年的利润有别于当年的应纳税所得额。原因是，在计算应纳税所得额时，要考虑上年度亏损的结转以及不符合财务规定的成本、费用和损失的剔除。只有当上年度结转的亏损为0时，以及项目公司发生的各项成本、费用及损失都符合国家有关财税规定时，才可以把项目公司当年的利润视为其应纳税所得额。
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