随着PPP项目的不断深入，PPP项目/SPV公司合同体系，按项目全过程管理，可分解为以下三大过程：
1、PPP项目前期顶层设计过程；本过程合同内容包括项目规划设计合同、项目建议书合同、可研合同、环评合同、能评合同、水土保持评估合同、稳评合同、PPP方案设计合同、物有所值评估和财政承受能力报告合同、招标代理合同等政府前期立项所需的合同文本。
2、PPP项目SPV公司建设过程：本过程合同体系内容包括：PPP项目合同、特许经营协议合同、设计、采购、施工合同、设备材料供应合同、能源消耗合同、投融资合同、保险合同、建设期审计合同等。此过程中合同体系较为复杂和多变，以政府和社会资本签署的PPP项目合同为基础，为推进项目而产生的合同系列必须符合PPP项目原则。
3、PPP项目SPV公司运营过程：本过程合同体系内容包括：SPV公司委托运营合同、设施维护合同、经营合同、法律咨询服务合同、设备材料采购合同、移交审计合同等。
对应于以上三过程，作为SPV项目公司来说，整个合同管理体系集中在以下几个阶段中，其合同管理体系内容如下：
1、招投标阶段
①合理划分子项目，明确各子项目的范围；
②确定项目的合同结构；
③策划各子项目的发包方式；
④起草、修改项目合同以及甲供材料和设备的采购合同；
⑤制定风险管理策略；
⑥在合同中采取有利的反索赔方案；
⑧制定合理的工程保险投保方案。
2、设计阶段
①分析和论证项目实施特点及环境，编制项目合同管理初步规划；
②分析项目实施的风险，编制项目风险管理的初步方案；
③从合同管理的角度为设计文件的编制提出建议；
④分析和编制索赔管理初步方案，以防范索赔事件的发生。
⑤从投资控制、进度控制和质量控制的角度分析设计合同条款，分析合同执行过程中可能出现的风险及如何进行风险转移；
⑥进行设计合同执行期间的跟踪管理，包括合同执行情况检查，以及合同的修改、签订补充协议等事宜；
⑦分析可能发生索赔的原因，制定索赔防范性对策，减少项目公司索赔事件的发生，项目公司处理有关设计合同的索赔事宜，并处理合同纠纷事宜；
3、施工阶段
①进行各类合同的跟踪管理，并定期提供合同管理的各种报告；
②项目公司处理有关索赔和反索赔事宜，并处理合同纠纷；
③工程变更管理；
④处理与保险有关的事宜。
4、动用前准备阶段
①进行各类合同的跟踪管理，并提供合同管理的各种报告；
②处理有关工程索赔事宜，并处理合同纠纷；
③处理合同中的未完事项。
综上所述，在整个PPP项目合作期限内，合同管理机制的建立有利于项目在全过程管理中控制在法律法规以及政策的允许范围内有效的运转，为项目的长期稳定保驾护航。
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